蛋白组学
蛋白质组学(Proteomics),是以蛋白质组为研究对象,研究细胞、组织或生物↙体蛋白质组成及其变化规律的科学。主要是利用高分辨蛋白质分离技∑术和高效的蛋白鉴定技术,在蛋白「质水平上整体、动态以及定量地研究生命现象和规律,是系统生物学的有机组成㊣ 分。
目前科学指南针提供TMT、iTRAQ、Label free、靶向蛋白组学等多种蛋白质组学技术,这些技术广泛应用于↓蛋白质的定性和定量分析╲。
代谢组学
代谢组学(metabolomics)是在后基因组学时代兴起的一门跨领域学科,其主要目标是定量的研究生命体对外界∞刺激、病理生理变化、以及本☉身基因突变而产生的其体内代谢物水平的多元动态反应。
组学技术服务涵盖非靶向代▼谢组学、靶向代谢组学以及其他代谢组学(Lipidomics)三大检测。
非靶※向代谢组,对样本进行全面的、无侧重的检测,通过比较找出差异代谢▓产物,并结合生物信息分卐析,找出富集差异通路,整合代谢网络。该检测旨在提供一个全面的∑ 研究视角来比较差异,通常用于标志物的筛选、分子机制研究★及多组学整合分析。
靶向代谢组学,即对明确的代谢产物进行定量分析检测,具有特异性强,检测〖灵敏度高和定量准确等特点,为后续深入代谢组学以及分子机制研ζ 究提供有力证据。
脂质】组学作为其他代谢组学重要分支,旨在系统分析生物体脂质分子组成、特性以及表达变化,为研究其在基因调控与蛋○白表达过程中的作用提供有力支持。
宏转录组学
宏转录组(Metatranscriptome)测序是指从整体水平上【研究某一特定环境,特定时期群体生命全部基因组转录情况以及转录调控规律的研究手段,它以RNA为研究对象,避开了微生物◤分离培养困难的问题,能有效的扩展微生物资源的利用空间。获取微生物组总▆RNA并去除rRNA之后,反转录为cDNA,并构建合适长度的插入片段文库,对这些々文库进行双端(Paired-end,PE)高通量测序,从而能精确定量整个菌群中具有ㄨ活性的物种精细组成及其对应功能ㄨ的表达水平,进而锁定菌群中的关键生物标记物、阐明其生物№学意义。
实验流程
宏基因组学
宏基因组学(Metagenomics)通过全基因组◎重测序(Whole Genome Shotgun, WGS),以特定环境中所有微生物基因组为研究对象,获取环¤境样品中的全基因组DNA,将提取¤获得的微生物组总 DNA 随机打断为短片段,并构建合适长度的插入片段文库,对这些文库进行双端 (Paired-end,PE) 高通量测序,展示微生物群落结构多样性,微生物群体基因组成及◥功能,特定环境相关的代谢通路等分析,从而进一步发掘和研究具有应用价值的基因及环境中微生物群落内部、微生物与环境间的相互□关系。宏基因组测序技术规避了绝≡大部分微生物不能培养、痕量菌无法←检测的缺点,因此近年来在环境微生物学研究中得到了广泛应用。
宏基№因组测试流程
转录组学
转录组测序是对某一物种或特定细胞在↓某一功能状态下产生的mRNA进行高通量测序,既可以提供定量分析,检测基因表达水〗平差异,又可以提供结构』分析,能发现未知转录本和稀有转录本,精确地识别可变剪切位点、基因融合、SNP以及Indel位点等,而且不依赖于参考★基因组。转录组学是从RNA水平研究■基因表达的情况,是研究细胞表型和功能的一个重要手段。
转录组学流程图
基因组学
基≡因组学是研究生物基因组的组成,组内各基因的结构、相互关系及表达调控的科学。基因组组学主要包括两方面的内♂容:以◥全基因组测序为目标的结构基因组学(structural genomics)和以基因功能鉴定为目标的功能基因组学(functional genomics),包括基因组测序和分析,通过使用高▂通量DNA测序和生信分析来组装和分析整个基因组的功能和结构。
线粒体全基因〒组圈图